Entre os objetivos dos Congressos Médicos de Passo Fundo estão proporcionar aos profissionais da medicina e da saúde da cidade e região a atualização de qualidade, além de estimular a pesquisa médica e consolidar a cidade como centro regional de difusão de conhecimentos.

A cada edição do Congresso são promovidos os Temas Livres. Os três melhores trabalhos científicos da sessão oral recebem premiação e os dois melhores trabalhos científicos da sessão pôster também são premiados.

Adicionalmente, os 5 trabalhos premiados (3 orais e 2 posteres) tem seus resumos submetidos para publicação, se o autor assim o autorizar.